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经典的统计技术和复杂的遗传基因大数据
时间: 2017-05-18 来源: 理学院 作者: 点击: 95

报告题目:经典的统计技术和复杂的遗传基因大数据

The power of simple statistical techniques in the era of big and complex data: some recent examples from genetic association studies

  

报告专家: 孙蕾,教授,加拿大多伦多大学统计科学系

Lei Sun, Full Professor, Department of Statistical Sciences, University of Toronto

  

摘要: 遗传关联研究旨在鉴别与某一感兴趣的性状/变量相关联的遗传标记, 其所用数据具有典型地规模大且复杂的特点.全基因组研究需扫描成大量的变量, 这其中: 缺失数据和测量误差时有出现;来自同一家庭的个体彼此相关;以及复杂的遗传病因又蕴含着复杂模型. 发展有利的机器学习方法正备受青睐. 在本次报告中, 我将通过一些实例来呈现一种可做补充的方法,这其中我们通过在较新的设置中考虑一些经典的统计技术,有效且可靠地从大规模遗传关联研究中提取到信息.这里所展示的工作主要基于我们:Derkach, Lawless and Sun (2014)发表在Statistical Science上的论文,Derkach, Lawless and Sun (2013) 发表在Genetic Epidemiology上的论文, Soave et al. (2015) 发表在American Journal of Human Genetics上的论文, 以及Soave and Sun (2017) 发表在Biometrics上的论文.

Genetic association studies aim to identify genetic markers associated with a heritable trait/outcome of interest. Data used are typically big and complex. Whole-genome studies scan through millions of variables where missing data and measurement errors are often present; individuals from the same family are correlated; and complex genetic etiologies imply complex models.  Developments favoring machine learning approaches are gaining popularity. As a complementary approach, in this talk I present some recent examples where we efficiently and reliably extract information from large-scale genetic association studies, by reconsidering some of the classical statistical techniques in newer settings. The work presented here are based on Derkach, Lawless and Sun (2014) Statistical Science, (2013) Genetic Epidemiology; Soave et al. (2015) American Journal of Human Genetics, and Soave and Sun (2017) Biometrics.

  

专家简介: 孙蕾,加拿大多伦多大学统计科学系、生物统计系教授,博士生导师。孙教授1995年本科毕业于复旦大学数学系,2001 年博士毕业于美国芝加哥大学统计系。她的研究领域是统计遗传学和统计基因组学,致力于发展统计方法和计算工具,以解决人类复杂性状遗传研究中的各类问题。其研究受到了加拿大自然科学及工程研究委员会(NSERC),加拿大健康研究所(CIHR)的资助,主持项目10 余项,累计科研经费达数百万加元;在BiometrikaBiometrics, Nature Genetics (Nature系列重要杂志)American Journal of Human Genetics等高水平杂志上发表科研论文 60 余篇;2017 年荣获加拿大数学研究中心和统计学会联合颁发的 CRM-SSC (统计学科学家专业成就奖);孙教授目前正担任多伦多大学统计科学系的研究副主席,2001 年以来担任加拿大NSERC, CIHR等多个基金项目的项目评审人. 2012 年至今担任国际著名生物统计学杂志 Genetic Epidemiology 编委,以及多个国际知名杂志的专业审稿人。详细内容见https://ssc.ca/en/awards/2017/lei-sun .

  

报告时间2017526日下午3

报告地点:理学院752会议室

邀请人:黄振生赵慧秀

主办单位:南京理工大学理学院统计与金融数学系

欢迎广大研究生和教师参加!


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